新疆生产建设兵团农三师医院成立于1965年，是一所集医疗、教学、科研为一体的二级甲等综合性医院，现有医疗用房及门诊建筑面积17,800余平方米，设置科室25个,核定床位250张，职工362人，其中医疗卫生技术人员308人,高级职称42人，中级职称123人。医院目前拥有百万元以上设备12台，50万元以上设备14台，十万元以上设备50余台，固定资产6000余万元。医院拥有22个科室，51团分院、伽师总场分院两个分院；精神心理科；三运司社区门诊、农三师机关卫生室两个社区门诊。医院还与卫生部中日友好医院、石河子医学院一附院、自治区肿瘤医院、新疆医学院、兵团医院建立了良好的协作关系，几年来开展新技术、新业务达40余项。
　　近年来，农三师医院的医疗技术水平有了长足的发展，心血管内科先后开展了冠状动脉造影术、PTCA支架植入术、心律失常射频消融术及周围血管造影术等；消化内科开展了胃镜下早期胃癌的诊断、食道及胃息肉胃镜下切除术、食道支架置入术、胆道逆行造影、十二指肠乳头括约肌切开胆总管取石术等技术，使诊断治疗有了质的飞跃；内分泌、神经内科等专业中的多项业务目前已在临床熟练开展；普外科在胆石症、肝肿瘤、胃肠肿瘤、食管肿瘤等难度较大的手术技术方面有了很大的突破；妇产科相继开展了微创子宫肌瘤切除术、新式剖宫产、阴式子宫切除术、无痛分娩、无痛人流等多项新技术。骨科在脊柱手术、人工全膝、全髋关节置换术、带锁髓内钉技术及腰椎间盘突出切吸术、颈椎间盘切吸术等方面的技术日渐成熟；耳鼻喉科已能独立开展鼻窦镜手术和鼾症手术。特别是农三师医院在腹腔镜手术、脊柱外科手术、肝胆外科手术、肿瘤手术等方面的诊断、治疗、手术在喀什地区具有先进水平。
　　医院现有美国GE-螺旋CT、热成像诊断系统、日本岛津心血管造影仪、柯达CR850（X线计算机图像清晰系统）、美国GE胃肠X光机、GE5OOmA拍片床、潘太克斯电子胃镜、菲利普彩色B超、史赛克腹腔镜、东芝全自动生化分析仪、日本7060大生化仪、前节激光治疗仪、德国电生理仪、眼针、YAG手术显微镜、血球分析仪、白内障超乳、电子纤维肠镜、高压氧仓等医疗设备。
　　多年来，农三师医院病人满意度始终保持在90%以上，医院连续13年被命名为兵团级“文明单位”，连续6年被评为兵团“民族团结进步先进单位”称号。